Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms