Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RFTN1Q14699 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms