Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms