Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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COL9A2Q14055 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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COL9A2Q14055 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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COL9A2Q14055 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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COL9A2Q14055 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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COL9A2Q14055 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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COL9A2Q14055 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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COL9A2Q14055 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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COL9A2Q14055 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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COL9A2Q14055 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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