Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COL9A3Q14050 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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