Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms