Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms