Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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