Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SP140Q13342 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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SP140Q13342 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SP140Q13342 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP140Q13342 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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