Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
ATMQ13315 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
ATMQ13315 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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