Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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SKP2Q13309 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SKP2Q13309 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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SKP2Q13309 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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SKP2Q13309 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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SKP2Q13309 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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