Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ERCC8Q13216 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERCC8Q13216 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERCC8Q13216 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ERCC8Q13216 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ERCC8Q13216 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ERCC8Q13216 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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