Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms