Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms