Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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