Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRZ1P23471 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms