Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN2BO60939 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN2BO60939 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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