Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SNPHO15079 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SNPHO15079 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SNPHO15079 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SNPHO15079 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SNPHO15079 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SNPHO15079 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SNPHO15079 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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