Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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FAM53CQ9NYF3 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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FAM53CQ9NYF3 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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FAM53CQ9NYF3 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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FAM53CQ9NYF3 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM53CQ9NYF3 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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