Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

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Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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UBR3Q6ZT12 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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UBR3Q6ZT12 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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UBR3Q6ZT12 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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UBR3Q6ZT12 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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UBR3Q6ZT12 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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UBR3Q6ZT12 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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UBR3Q6ZT12 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBR3Q6ZT12 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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