Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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RTL8BQ17RB0 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RTL8BQ17RB0 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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