Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FOXD1Q16676 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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