Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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