Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNHIT3Q15649 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZNHIT3Q15649 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms