Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TAF1AQ15573 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms