Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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NR6A1Q15406 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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NR6A1Q15406 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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NR6A1Q15406 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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NR6A1Q15406 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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NR6A1Q15406 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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NR6A1Q15406 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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NR6A1Q15406 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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NR6A1Q15406 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NR6A1Q15406 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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