Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TTF1Q15361 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms