Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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NKX1-1Q15270 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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NKX1-1Q15270 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NKX1-1Q15270 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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