Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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GPNMBQ14956 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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GPNMBQ14956 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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