Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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DDX39BQ13838 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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DDX39BQ13838 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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DDX39BQ13838 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DDX39BQ13838 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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