Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HDAC1Q13547 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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