Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP3B2Q13367 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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