Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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ERCC8Q13216 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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