Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CALCOCO2Q13137 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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