Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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