Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPN13Q12923 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPN13Q12923 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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