Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms