Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
EPHB4P54760 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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