Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPREP23469 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPREP23469 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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PTPREP23469 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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PTPREP23469 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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