Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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PTPRBP23467 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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PTPRBP23467 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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PTPRBP23467 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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PTPRBP23467 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRBP23467 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRBP23467 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRBP23467 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRBP23467 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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