Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL24A1Q17RW2 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms