Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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