Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRADDQ15628 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms