Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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SIX1Q15475 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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SIX1Q15475 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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