Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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SYCP1Q15431 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYCP1Q15431 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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