Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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PDK3Q15120 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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PDK3Q15120 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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PDK3Q15120 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PDK3Q15120 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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