Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
APOFQ13790 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
APOFQ13790 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
APOFQ13790 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
APOFQ13790 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
APOFQ13790 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
APOFQ13790 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
APOFQ13790 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
APOFQ13790 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
APOFQ13790 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
APOFQ13790 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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APOFQ13790 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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APOFQ13790 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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APOFQ13790 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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APOFQ13790 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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APOFQ13790 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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APOFQ13790 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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APOFQ13790 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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APOFQ13790 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
APOFQ13790 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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