Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CAMK2BQ13554 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms