Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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SGCGQ13326 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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SGCGQ13326 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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SGCGQ13326 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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