Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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CLN3Q13286 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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